وفقًا لطبيعة أعمال ونشاطات البرنامج الوطني للمعارض والمؤتمرات، ومن أجل قيام البرنامج باختصاصاته بشكل فعّال لتحقيق التنمية المستمرة لصناعة الاجتماعات في المملكة، فقد تم بناء الهيكل التنظيمي على النحو التالي:
